Proporcionar aos profissionais da ciência agrária uma introdução à Bioinformática e à Biologia Computacional, com ênfase nos problemas computacionais e algoritmos comumente usados para alinhamento e análise de sequências e técnicas de triagem virtual de drogas com aplicação no setor agropecuário. Ao final deste curso o cursista deverá estar apto a: conhecer um pouco da história e do que é a bioinformática. Saber o que são e como usar bancos de dados para bioinformática. Compreender os algoritmos básicos de alinhamento de sequência e quando eles devem ser usados. Modelar proteínas utilizando algoritmos de computador. Realizar uma docagem molecular. E ter uma compreensão do processo de Dinâmica Molecular”
Estudantes curso Técnico que atuam no setor agropecuário, Profissionais de nível superior Agrônomos, Veterinários, formados ou em formação acadêmica.
Introdução a Bioinformática e a programação Python
(CH T: 2horas /CH L: 3horas /CH P: 2horas)
- Breve histórico da bioinformática
- Algoritmos de Margaret Oakley Dayhoff Point Accepted Mutation (PAM) primeiros algoritmos usados em bioinformática.
- Introdução a programação Python Breve compreensão da linguagem (variáveis, listas, tuplas, dicionários, loops e condicionais)
Banco de Dados e Recuperação de Informações & Alinhamentos
(CH T: 2horas /CH L: 3horas /CH P: 2horas)
- Sequenciamento e GenBank.
- Protein Data Bank.
- PubChem, ZINC 14 etc.
Trabalhando com as proteínas: Modelos Tridimensionais
(CH T: 2horas /CH L: 3horas /CH P: 8horas)
- Instalação PyMOL.
- Comandos básicos do PyMOL.
- Uso do software Chimera e ChimeraX
Modelagem Molecular
(CH T: 2horas /CH L: 3horas /CH P: 12horas)
- Introdução à Modelagem Molecular
- Modelagem Comparativa por Homologia
- Modelagem por Threading
- Modelagem Ab initio / De novo
- Prática modelagem de sequencias proteicas de organismos de interessa agropecuário.
Mutações e estudos computacionais para descoberta de novos fármacos: Drug Design
(CH T: 4horas /CH L: 3horas)
- Atracamento Molecular (Docking Molecular)
- Discussão teórica de Drug-Design
- Algoritmos e potencialidade na Ferramenta
Prática docagem molecular
(CH L: 3horas /CH P: 12horas)
- Prática com Autodock Vina
- Técnicas de Drug Design (QSAR, Dinâmica Molecular).
Introdução à Dinâmica Molecular
(CH T: 4horas /CH L: 3horas /CH P: 12horas)
- Uso do VMD (Visual Molecular Dynamics) e do NAMD (Scalable Molecular Dynamics)
- Introdução ao Uso do Grommacs
- Serão usadas a práticas dos Tutoriais dos referidos programas de Dinâmica Molecular.
Professor Eduardo José Azevedo Corrêa
Graduado em Ciências Biológicas com Licenciatura e Bacharelado, Mestrado em Biologia vegetal. Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular, UFSJ.
Serão disponibilizados materiais para leitura, áudio aulas, vídeo-aulas, estudos dirigidos, fóruns e tarefas, que serão realizadas online, no AVA (Ambiente Virtual de Aprendizado) do ITAP. Todas estas atividades totalizarão 21 horas, com atividades síncronas e assíncronas e participação do professor. Durante esta etapa, além do aprendizado com as técnicas do curso pretende-se que o cursista familiarize-se com técnicas do aprendizado em AVAs. Para tanto, o cursista necessário de um computador com acesso à internet.
O curso também será oferecido na versão presencial, com carga horaria de 67 horas, realizadas no ITAP. Serão 19 horas teóricas, seguidas por 48 horas de aula prática. Dessa forma, o aluno verá na prática a aplicação das técnicas possibilitando discussões sobre o conteúdo já estudados, permitindo que as aulas sejam mais interativas e que haja maior fixação dos conteúdos ministrado.
Total de horas do curso: 88 horas
Para o recebimento do Cerificado será exigido a aprovação no curso. Para aprovação no curso, o cursista deverá ter nota igual ou superior a 60%.
Gratuito